近日,云南菌视界在《菌物学报》首发论文《基于基因组重测序成立橙白耳包革(金耳菌)菌株的辩别标识》,通过基因组测序技能,收效成立出橙白耳包革(金耳菌)菌株的辩别标识,为金耳菌品种纰漏和学问产权保护提供了有劲支捏。
《菌物学报》月刊英文刊名Mycosystema,1982年创刊,由中国科学院微生物征询所和中国菌物学会鸠合驾驭,主要刊登我国菌物学(包括真菌、黏菌、卵菌)征询界限在表面上和扩充上的最新征询后果。在CNKI《中国粹术期刊影响因子年报》中最新影响因子3.392;在《科技期刊天下影响力指数(WJCI)讲明》中叶界影响因子2.396;入选“2024中国最具国外影响力学术期刊”。
据先容,金耳菌是我国贫乏的食用菌品种,具有养分丰富、口感鲜好意思等特色,深受破费者谨慎。可是,由于金耳菌品种蕃昌,品种纰漏一直是产业发展中的难题。比年来,跟着基因组测序技能的快速发展,基因组测序在食用菌品种纰漏中的应用也越来越庸俗。
比年来,云南农业大学李荣春训导率领云南菌视界团队针对金耳菌品种纰漏难题,以橙白耳包革(金耳菌)单孢菌株NX-20基因组为参考基因组,迪士尼彩乐园以4个不同型单孢菌株D13、D25、D40和D47基因组重测序数据为征询对象,利用生物信息学软件纰漏出广泛的SNP和InDel变异位点,并分析其特征。当今已赢得以下主要征询后果:
筹算SNP/InDel标识引物:征询团队使用primer5.0软件筹算了一系列SNP和InDel标识引物,筛选出8对存在多态性相反的SNP标识引物和6对InDel标识引物。
遗传各样性分析:征询团队将筛选出的标识引物应用于我国金耳栽植产业中庸俗使用的14个金耳菌菌株,进行遗传各样性分析。终结走漏,J2F1菌株在8对SNP引物中均造成2种基因型,其他菌株仅有一种基因型;6对InDel标识引物分析终结走漏,J2F1菌株在第1、2登科5对引物中能扩增出不同于其他菌株的条带,大部分菌株能扩增出一致的条带,走漏出同种异名表象。
分子标识应用远景:征询团队筛选得到的SNP和InDel标识可进一步用于金耳菌遗传分析,为金耳菌遗传各样性、种质资源纰漏和保护及分子赞成育种等征询助力。
围绕云南野生菌种质资源成立和食用菌利用,云南菌视界袭取科技革命理念,与中国科学院微生物征询所、上海农科院食用菌征询所、中国药科大学等多家科研院所张开和谐,助力中国食用菌的发展。这次征询后果的发表,彰显了云南菌视界在食用菌基因组学征询界限的实力。跟着基因组测序技能在食用菌品种纰漏中的应用,将为我国食用菌产业的昌盛发展提供强有劲的科技支捏。
云南网记者王永刚迪士尼彩乐园